| 大阪大学-島津分析イノベーション協働研究所は、特定非営利活動法人システム・バイオロジー研究機構（SBI）と、大阪大学、島津製作所との共同研究の成果をもとに、す とり っ ぷ ルーレットデータの自動可視化など解析支援ソフトウェアワークフローの開発と、研究課題解決への応用を進めています。 解析支援ソフトウェアワークフローは、SBIを中核とする世界の研究機関コミュニティGaruda Allianceが開発する共通プラットフォームGaruda Platform上に公開されている各種のガジェットをベースに開発されており、その成果は、｢す とり っ ぷ ルーレット解析パッケージ｣として公開、製品化もされています。 |  |
す とり っ ぷ ルーレット解析パッケージの使用により、測定データの代謝マップへの自動可視化、化合物変化量のグラフ表示など、ボトルネックとなるデータ解析・可視化の作業の大幅な削減が可能、創薬や診断、バイオ工学などライフサイエンス研究をサポートします。
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Volcano Plot t検定（統計的有意差）とfoldす とり っ ぷ ルーレット（例：2倍、1/2など平均値の差）を組合せた手法で、2群間の差の可視化が可能なツールです。島津製作所が開発のVolcano Plot ガジェットがパッケージに組み込まれています。 |
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VANTED 豪州 Monash UniversityによりGARUDAサポートされ、独University of Konstanzが維持するデータ間のネットワークの可視化とす とり っ ぷ ルーレットのためのツールです。代謝物プロファイリングや酵素活性データを代謝マップ上で可視化し、生物学的プロセスのす とり っ ぷ ルーレットをサポートします。 |
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Cytoscape Cytoscape Consortiumにより開発された代謝パスウェイの可視化や遺伝子発現プロファイルと関連データの統合などに用いられるバイオインフォマティクス用のツールです。ネットワーク分析、相関の可視化に威力を発揮します。 |
す とり っ ぷ ルーレット解析パッケージには、解析用の各ガジェットと接続するデータ加工用のガジェットが収載されており、あたかも1つのソフトウェアとして使用いただくことができます。島津製作所の各種メソッドパッケージとも連動し、質量分析装置による測定からデータ解析までの操作をスムーズに実施いただけます。
VANTEDに用いるMSデータの貼り付け用の白地図（代謝マップ）をダウンロードいただけます。また、す とり っ ぷ ルーレットの白地図の作成方法をまとめましたのでご参照ください。
