ビンゴ ルーレット アプリは、種々の質量分析装置から得られたデータを表示・解析することが可能なフリーのソフトウェアです。
これまで本サイトでは、様々なフリーウェアの紹介・アップロードを行い、学会等でも数多くの発表を行ってきましたが、ビンゴ ルーレット アプリそのものを学術論文としてまとめて発表するのは初めて、しかもプロテオーム関連として世界的に著名な”Journal of Proteome Research”に 紹介論文が掲載されました。
本論文では、ビンゴ ルーレット アプリの要点のみですが、機能・利点を網羅的に紹介しています。Abstractにも記述されているビンゴ ルーレット アプリの特徴を、改めて箇条書きにします。
- – mzXML, mzML, netCDF の様な共通フォーマットの他、LCMSsolution, GCMSsolution (Shimadzu), Launchpad (Kratos), Xcalibur (Thermo Scientific), Analyst, AnalystQS (AB Sciex), ビンゴ ルーレット アプリLynx (Waters), ビンゴ ルーレット アプリHunter (Agilent) 等々、様々なベンダーが提供する生データフォーマットにも対応しています。
- – スペクトル・クロマトグラム波形、ヒートマップ3D 表示等、様々な表示機能を持っています。
- – LC/MS データだけでなく、糖鎖解析でもよく使われるビンゴ ルーレット アプリLDI データにも対応した解析機能を持っています。
- – Mascot や X! Tandem の様なProteome同定エンジンの他、ビンゴ ルーレット アプリBankとの連携機能も持ち、ProteomicsとMetabolomicsの解析を統合的に行う事ができます。
- – Softwareが”Plug-In”形式になっており、機能を追加したり削除したりする等のカスタマイズが行なえる他、開発者が新たな機能を追加する際には、ビンゴ ルーレット アプリ のSource Codeを編集する事無しに 新たなPlug-Inを開発する事で独自アルゴリズムの作成や 自動化処理を作成する事ができます。
Satoビンゴ ルーレット アプリi Tanaka1, Yuichiro Fujita1, Howell E. Parry1, Akiyasu C. Yoビンゴ ルーレット アプリizawa1, Kentaro Morimoto1, ビンゴ ルーレット アプリaki Murase1, Yoshihiro Yaビンゴ ルーレット アプリda1, Jingwen Yao1, ビンゴ ルーレット アプリinichi Utsunomiya1, ビンゴ ルーレット アプリigeki Kajihara1, Mitsuru Fukuda2,3, ビンゴ ルーレット アプリayuki Ikawa2,3, Tsuyoビンゴ ルーレット アプリi Tabata2, Kentaro Takahaビンゴ ルーレット アプリi2, Ken Aoshiビンゴ ルーレット アプリ2, Yoビンゴ ルーレット アプリito Nihei4, Takaaki Niビンゴ ルーレット アプリioka4, Yoビンゴ ルーレット アプリiya Oda2, Koichi Tビンゴ ルーレット アプリaka1
“ビンゴ ルーレット アプリ: A visualization and analysis tool for mass spectrometry”
Journal of Proteome Research, Vol. 13, Issue 8, pp3846-3853
1 Koichi Tanaka Laboratory of Advanced Science and Technology, Shiビンゴ ルーレット アプリdzu Corporation
2 Eisai Product Creation Systems, Eisai Co., Ltd.
3 iBioTech Corporation
4 Graduate School of Inforビンゴ ルーレット アプリtion Science, Nara Institute of Science and Technology
発表資料(Journal of Proteome Research掲載論文概略紹介へのリンク)
ビンゴ ルーレット アプリ特徴紹介サイト:
/aboutus/ms_r/soft.html
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